MDS' de tedavi semptomlara, hastalığın evresine, hastalık risk kategorisine, yaş ve halen mevcut tıbbi durumlara bağlıdır. MDS' de farklı tedavi seçenekleri bulunmasına rağmen her tedavi her hasta için           uygun değildir.
Çocuk ve gençlerde tercihen yakınlardan bulunan uygun vericiden kemik iliği transplantasyonu yapılması günümüzde ulaşılabilir yegane küratif(şifa sağlayıcı) tedavi yöntemidir.

Kemik iliğinde anormal displastik hücreleri baskılayan veya yok eden ve/veya sağlıklı hücrelerin matürasyonunu uyaran ilaç tedavileri halen araştırılmaktadır.

MDS' de tek başına veya birlikte kullanılabilen tedavi  stratejileri aşağıda özetlenmiştir.           

• Destek tedavi;

1.  Anemi bulgularının tedavisi için kan transfüzyonları ve aşırı demir yükünün tedavisi için demir şelasyon tedavileri
2. Trombositopeni için platelet transfüzyonları
3. Dirençli veya rekürren infeksiyonlara karşı antibiyotik tedavisi

• Kemik iliğinde beyaz kan hücreleri, kırmızı kan hücreleri ve platelet üretecek sağlıklı blastları stimüle edecek eritropoetin gibi kan büyüme faktörleri
• Myelodisplazi gelişiminde rol oynayan biyolojik mekanizmaları hedef  alan yeni ilaç tedavileri